“กระบี่เย้ยยุทธจักร 2” (หม่าจิงเทา) เป็นเรื่องราวของการต่อสู้และความเข้าใจผิดในยุทธจักร เมื่อสำนักคุ้มกันภัยบุญบารมีถูกกวาดล้างอย่างไร้ความปราณี เหลือเพียง “หลินผิงจือ” ลูกชายเจ้าสำนักที่รอดชีวิต เขาถูก “เยวี่ยปู้ฉิง” เจ้าสำนักหัวซานรับเป็นศิษย์ เพื่อช่วยฟื้นฟูความแข็งแกร่ง
ในขณะเดียวกัน “เล่งฮู้ชง” ศิษย์คนโตของสำนักหัวซานได้เดินทางไปยังพิธีล้างมือในอ่างทองคำของ “หลิวเจิ้งฟง” แต่กลับพบเหตุการณ์ที่ทำให้หลิวเจิ้งฟงถูกกล่าวหาว่าเป็นสหายกับ “ชีหยาง” คนของพรรคมาร ทั้งสองถูกบีบให้หลบหนีจากการไล่ล่าของยุทธจักร
ความจริงที่น่าเศร้าคือ หลิวเจิ้งฟงและชีหยางเป็นเพียงเพื่อนที่มีความรักในดนตรีร่วมกัน พวกเขาได้ร่วมกันแต่งเพลง “เย้ยยุทธจักร” ที่แสดงถึงเสรีภาพและความผูกพันในยุทธจักร แต่สุดท้ายทั้งสองก็ถูกเข้าใจผิดและเสียชีวิตก่อนที่จะมอบสมุดโน้ตเพลงให้กับเล่งฮู้ชง ซึ่งทำให้เล่งฮู้ชงถูกเข้าใจผิดว่าเป็นผู้ครอบครองคัมภีร์กระบี่ล้ำค่า และยังถูกกล่าวหาว่าเป็นศิษย์ทรยศของสำนักหัวซาน